为了助推合成生物学的蓬勃发展，美迪西云讲堂特邀生物部高级研究员/项目经理刘超 博士带来直播《合成生物学&生物催化在生物制药领域的应用》。点击链接“//czchengteng.com/video/syntheticbio-catalysis.shtml”，回顾刘超博士全场直播。

Q 请问美迪西对于酶的改造优化的周期是多久？

刘超博士：在美迪西，我们能够在2至3个月的时间内完成两轮酶的进化过程，期间会对大约2000个突变体进行筛选和检测，以确保优化效果。

Q 美迪西进行酶改造有没有什么经验可以分享的吗？

刘超博士：当然，美迪西在酶改造方面积累了丰富的经验。首先，我们拥有一套完善的SOP（标准操作流程），这些SOP都是经过实战检验、行之有效的。其次，我们深知并非所有酶都能通过改造提高催化性能，因此需要在投入和产出之间找到平衡。与科研机构不同，我们不能长时间专注于一个课题的研究，而是需要在有限的时间内取得尽可能多的成果。如果经过SOP流程后，酶的性能仍未得到显著提升，我们会与客户进行充分沟通，共同探讨后续方案。

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Q 请分享一下美迪西酶改造的SOP？

刘超博士：美迪西酶改造SOP结合了理性设计和半理性设计的理念。理性设计主要依据保守性分析和自由能变化，结合氨基酸在3D结构中的位置来确定改造目标。不同的人可能会使用不同的软件进行分析。而半理性设计则参考了德国马普所的Reetz教授提出的组合活性中心位点的策略，我们设计了简并密码子，进行有限的饱和突变，以期获得性能更优的酶。

Q 关于高通量筛选，刘老师有什么好的建议吗？

刘超博士：这个问题确实非常关键。在酶的定向进化过程中，突变体文库筛选的通量往往成为制约研究进度的瓶颈。虽然这个问题具有一定的挑战性，但我们可以借鉴一些成功的策略来应对。正如美军在战争中采用的“火力覆盖，地毯式轰炸”战术一样，我们也需要一种能够全面、高效地覆盖所有突变体的筛选方法。在美迪西，我们采用HPLC（高效液相色谱）进行逐一检测，这种方法虽然耗时较长，但能够确保每一个突变体都得到充分的检测，从而筛选出性能更优的酶。虽然目前尚未有一种完美的、通用的高通量筛选方法，但我们认为，通过不断优化筛选流程和提高检测效率，我们可以逐步逼近这一目标。

在新药研发的临床前研究阶段，如果您有任何不解之处，或者对某个专题有深入研究的兴趣，请提出您的问题和宝贵意见。美迪西将全力支持，与您携手共进，在新药研发的道路上一起探索前行。

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